W zakresie rozliczania podatku VAT dotyczącego udzielnych przez powiatowe urzędy pracy środków na podjęcie działalności gospodarczej oraz refundację doposażenia lub wyposażenia stanowiska pracy zastosowanie mają przepisy rozporządzenia Ministra Pracy i Polityki Społecznej z 23 kwietnia 2012 r. w sprawie dokonywania z Funduszu Pracy refundacji kosztów wyposażenia lub doposażenia stanowiska pracy dla skierowanego bezrobotnego oraz przyznawania środków na podjęcie działalności gospodarczej.
W przypadku refundacji kosztów wyposażenia lub doposażenia stanowiska pracy dla skierowanego bezrobotnego zastosowanie ma § 4 ust. 2 pkt 6 ww. rozporządzenia, w którym mowa, że umowa o refundację powinna być zawarta na piśmie pod rygorem nieważności oraz zawierać w szczególności zobowiązanie podmiotu do zwrotu równowartości odliczonego lub zwróconego, zgodnie z ustawą z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. z 2011 r. Nr 177, poz. 1054, z późn. zm.10), podatku naliczonego dotyczącego zakupionych towarów i usług w ramach przyznanej refundacji.
W przypadku środków na uruchomienie działalności gospodarczej obowiązują zapisy  § 8 ust. 2 pkt 5 ww. rozporządzenia. Zgodnie z nimi umowa o dofinansowanie zawarta z bezrobotnym, któremu udzielona jest ta forma wsparcia, zawiera zobowiązanie do zwrotu równowartości odliczonego lub zwróconego, zgodnie z ustawą z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług, podatku naliczonego dotyczącego zakupionych towarów i usług w ramach przyznanego dofinansowania.