Wskaźniki horyzontalne są już umieszczone w formularzu wniosku o dofinansowanie, tak więc nie muszą być wpisywane/wybierane. Jeżeli przedmiotowe wskaźniki na etapie przygotowywania wniosku o dofinansowanie nie dotyczą założeń projektu to w polach dotyczących wartości docelowych wskaźników należy wpisać „0". Wówczas pola: „źródło danych do pomiaru wskaźnika" oraz „sposób pomiaru wskaźnika" mogą pozostać nie wypełnione. Niemniej jednak wnioskodawca zobowiązany jest do monitorowania przedmiotowych wskaźników, tak więc jeżeli na etapie realizacji projektu nastąpi przyrost danego wskaźnika (np. w projekcie pojawi się wydatek związany z racjonalnymi usprawnieniami) fakt ten należy odnotować we wniosku o płatność.